Abschlussarbeit (Master) - Einfluss von Endophyten auf die Totholzkolonisierung?

Das UFZ

Das Helmholtz-Zentrum für Umweltforschung - UFZ hat sich mit seinen 1100 Mitarbeiterinnen und Mitarbeitern als internationales Kompetenzzentrum für Umweltwissenschaften einen hervorragenden Ruf erworben. Wir sind Teil der größten Wissenschaftsorganisation Deutschlands - der Helmholtz- Gemeinschaft. Unsere Mission: Wir forschen für eine Balance zwischen gesellschaftlicher Entwicklung und langfristigem Schutz unserer Lebensgrundlagen - für eine nachhaltige Entwicklung.

Die Stelle

Im Rahmen der Deutschen Biodiversitäts-Exploratorien wird untersucht, welche Auswirkungen Landnutzung auf Biodiversität und Ökosystemprozesse hat. Mit dem BESterile-Experiment (Biodiversity Exploratories deadwood sterilization experiment) konzentrieren wir uns auf die Mechanismen der Artenbesiedlung von Totholz und die damit zusammenhängenden Prozesse unter verschiedenen Waldbewirtschaftungsintensitäten. Zu diesem Zweck wurden die Stämme von zwei Hauptbaumarten mitteleuropäischer Wälder (Fagus sylvatica und Picea abies) teils gammasterilisiert, um die Mikroorganismen im lebenden Baum zu inaktivieren. Im Rahmen dieser Abschlussarbeit soll nun die frühe bakterielle Besiedlung des Totholzes und der Einfluss der Endophytengemeinschaft im lebenden Baum auf die Totholzkolonisierung untersucht werden. Diese Arbeit ermöglicht Einblicke in den kompletten Ablauf einer DNA-basierten Gemeinschaftsanalyse mittels Amplikonsequenzierung (Metabarcoding), wobei für alle Schritte eine intensive Betreuung geboten wird. Bei Interesse könnten wir vorab eine 3-monatige Stelle als studentische Hilfskraft (d/m/w) anbieten.
Die Stelle zur Erstellung der Masterarbeit wird am Standort in Halle (Saale) betreut.

Ihre Aufgaben

• pH- und Wassergehaltsmessungen von Totholzproben
• DNA-Extraktion
• Amplifizierung (PCR) der mikrobiellen DNA
• Gelelektrophorese und Aufreinigung der sog. Amplikons
• Assistieren bei der Vorbereitung der Sequenzierung (Library-Präparation)
• Bioinformatische und statistische Auswertung der erzeugten Daten und Generieren von Ergebnissen

Wir bieten

• Eine hervorragende Betreuung, die Ihre persönliche und professionelle Entwicklung unterstützt
• Spannende Einblicke in die Arbeit eines führenden Forschungsinstituts
• Die Chance, in interdisziplinären, internationalen Teams zu arbeiten und von vielfältigen Perspektiven zu profitieren
• Die Möglichkeit, von Anfang an eigene Ideen und Impulse einzubringen und aktiv mitzugestalten
• Moderne technische Ausstattung und IT-Service, um Ihre Arbeit optimal zu unterstützen

Ihr Profil

• Studienhintergrund einer geeigneten Fachrichtung (Biologie, Umweltwissenschaften oder andere Naturwissenschaften)
• Sauberes und gewissenhaftes Arbeiten im Labor
• Freude an mikrobiell-ökologischen Fragestellungen
• Teamfähig, flexibel und hohes Maß an Eigeninitiative
• Statistikgrundkenntnisse und Erfahrung im Umgang mit R von Vorteil
• Erfahrungen mit sterilen bzw. molekularen Arbeiten wünschenswert